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计算机学院高琳:讨论交流对研究工作促进很大
时间:2012-08-30 16:45:59来源:党委宣传部点击:

讨论交流对研究工作促进很大
——访计算机学院高琳教授

  学生记者 闵青云 韦钰

  记 者:高琳老师您好,感谢您接受本报的采访。请简单介绍一下您在加拿大圭尔夫(Guelph)大学访学时的研究工作。

  高 琳:我读博士时的研究方向是生物计算,研究的计算问题需要生物实验验证,如果毕业后继续这个方向,我在西电的科研条件无法满足这种新兴的交叉学科的实验需要。于是我便想出国深造,希望能够进一步找到这个涉及数学、计算机、生物的交叉学科里我适合的方向。

  我申请了国家留学基金委的访问学者计划,得到公派出国深造的机会。随后联系了Guelph大学的DavidK.Y.Chiu教授,他在该领域进行了长期的研究。Guelph大学连续多年在加拿大国内大学排名位列前十,也曾被评为加拿大最全面的大学。为此,我感到十分荣幸。访学期间,Guelph大学优良的教学和科研氛围、强大的师资力量以及合作导师DavidK.Y.Chiu教授对我的帮助使我对生物信息学这门学科有了更深入的了解。在这里,我寻找着要研究的方向,努力结合自己熟悉的理论知识。访学期间,我完成了Chiu教授开设的生物信息学课程的学习,参与了他们的讨论,也完成了一个国家自然科学基金资助项目——《生物分子网络数据分析中相关图问题及其算法研究》的申请,得到资助。该项目的成功申请,对于我以后的研究起到了至关重要的作用,后来我在该领域的研究中得到国家自然科学基金的重点项目以及重大研究计划项目的资助。

  记 者:国外高校课堂上的交流氛围和国内相比如何?这对于您回国后的教学、科研有什么影响?

  高 琳:与我合作的DavidK.Y.Chiu教授非常重视学术讨论。在他开设的生物信息学课程中,我们大家自由交流。此外,每周二上午是导师与我单独讨论的固定时间,分析一周来学习的心得和遇到的问题。教授很看重这个讨论。这样有规律而直接的讨论交流对我的研究工作促进很大。

  为了尽快熟悉这一领域,我在网上联系到了加拿大Waterloo大学的李明教授,他也是计算生物信息领域执牛耳的人。Guelph大学在圭尔夫市,Waterloo大学在滑铁卢市,两个城市虽不远,但是坐巴士往返也需要很长时间。让我感动的是,李明教授在知道了我需要乘坐巴士前往之后,主动提出要开车接我去Water-loo大学参与他们的学术讨论,丝毫没有一个学术名人的架子,更像是老朋友。国外大学自由的学术交流方式、单纯质朴的学术氛围对我触动很大。

  总的来说,访学时与合作导师良好的合作、密切的讨论,还有活跃宽松的研究氛围都让我获益良多。

  我们作为导师就是要给予学生正确的方向引导,和学生平等交流,善于发现学生的优缺点,同时放大学生的优点,缩小他们的缺点。积极的肯定很大程度上是一种推进研究的动力。导师要了解学生的心理,做到及时疏导、减轻他们的压力,营造一个轻松的研究环境。

  记 者:访学期间,您积极与国外同行联系,建立了良好的关系和工作沟通渠道,搭建了合作平台。请问您与国外研究者沟通时最重视最注意的一点是什么?

  高 琳:我属于性格乐观的一类人,平时与人交往真诚相待,做研究是一件很快乐的事情,为什么要那么严肃呢?在加拿大时,我在Guelph大学里的研究常常会遇到各种生物方面的问题,恰巧DavidK.Y.Chiu教授有个学生在这方面很擅长,我就经常向他请教,他的解答也很热情、耐心。这件事以及李明教授接送我往返两所大学等事情说明,我身边有很多善良热心的人,他们学术有成,为人挚诚。这不仅很让我感动,也是我肯定的交往方式。

  大家在一起相识不就是因为彼此对学术上的热爱吗?简单、真诚是我一直追求的,也是我一直以来做人的方式。要把复杂的事物简单化、乐观向上,才能使自己有积极的态度。我认为人生就是要简单真实,不需把问题复杂化。生活本不容易,为什么不尽量过得开心一点、轻松一点呢?

  研究需要与国内外同行进行广泛的交流,近年来,我参与的学术活动比较频繁,主办或参加了IEEEISB会议(IEEE InternationalConference onSystem Biology)、IEEE BIBM 会 议(IEEE InternationalConference onBioinformaticsandBiomedicine)、全国生物信息学联合会议、基金委“生物信息学重大基础科学问题及关键技术”双清论坛学术研讨会等活动。这类顶尖的学术会议可以促进学界同行们的交流,又能给年轻人提供一个沟通的平台。这也算是我为自己喜爱的事业尽了一份力。

  记 者:访学经历对您的教学工作有哪些积极影响?您是否把一些国外经验结合到了自己的教学研究当中?

  高 琳:我从国外回来以后,也借鉴了他们的经验——每周举办一次课题组的讨论班。每学期末,我都会让学生写这一学期的总结以及对下一学期的计划,然后我会分别找同学一对一沟通讨论,平时学生每个月都要写总结。高年级研究生每个人每学期做一次面向我和其他同学的报告:讲论文,讲想法,这既能引起同学们的讨论和思考,也训练了他们的 “输出能力”——即总结归纳、深入浅出的能力。这对他们自身的素质提高有很大的帮助。

  西电的学生本身基础都很好,老师应该为学生的发展创造尽可能多的有利条件。我现在和国内许多优秀的研究机构如中科院数学与系统科学研究院、中科院计算所、上海生科院等有比较密切的联系,和许多学术名家、一线研究者也保持了较好的互动。我有许多优秀的学生都到了那里去学习深造。而且这些机构负责人、研究员也经常到我校做报告。频繁的学术交流给学生提供了很多机会,也让大家接触到了一流的前沿的信息。现在,我的学生们也经常通过邮件、电话等方式,与这些战斗在研究工作最前线的 “学术中坚力量”进行交流沟通。我做这些都是为了让学生能有更好的发展,让他们即使身处内地,也能放眼世界。

  博士生通过两年的深入学习与钻研,在主攻具体方向的知识应该超过自己的导师,之后我反而要向他们学习。学生是老师最重要的财富!

  记 者:您回国后在学院成立计算生物信息学研究所的初衷是什么?

  高 琳:科研需要不断找到新的学科增长点。计算生物信息学(Com-putationalBioinformatics)是生命科学中以数学、统计、计算机与生物医学为基础的新兴的交叉学科,且是以数学、统计为手段,以计算机为工具对生物数据进行储存、检索和分析的科学。随着人类基因组计划(HGP)的不断推进及生物技术的发展产生的新型数据,借助计算机的算法及软件对这些数据的分析成为该领域目前研究的焦点,计算生物信息学已经成为当今生命科学和自然科学的核心领域和最具活力的前沿领域之一。

  成立研究所的宗旨在于开展生物信息技术领域的原创性研究,建立具有广泛应用前景和国际先进水平的生物信息分析、数据挖掘和知识发现的理论体系。我希望依托西电信息学科优势,用信息和系统的观点和方法研究现代生物学和医学科学中的基础问题,促使西电在这一交叉领域快速发展,占领新的信息应用领域制高点,拓展西电新的学科方向,并在研究中培养前沿研究人才。

  记 者:高老师,最后请您结合您多年的治学经验,以一个过来人的身份给广大西电学子一些学习建议好吗?

  高 琳:个人的精力是有限的,一个阶段只能做一件事情,要做,就要尽力把事情踏实地做好。如果你想要别人认可你,你需要有一个“标签”,使得别人一看到你,就能知道你擅长某一领域。

  要想日后在科研上有建树,本科时期要打下坚实的基础。随着时间的推移和研究的深入,你对基础知识的理解就越是深刻。创新的源泉就是基础。研究生、博士生阶段主要是丰富自己对某一问题深刻的认识,并上升到理论的层面解决。对博士生的要求是撰写论文,加强自身学术研究能力,积累学术经验。只有自己的学术经验积累到一定程度,站在了一定的高度上,才能有更多的机会,才可能有更好的发展。

  我们的研究不但需要数学、计算机专业扎实的基础理论知识,也需要学习基本的分子生物学基础知识,以理解解决问题的背景。一本全英文生物教材,为了让学生更透彻地了解,我要求他们自主学习,分工讲解。长的章节两人讲一章,短的章节一人讲一章,每两周进行三次讨论。这种授课模式虽然很累,但是很能解决问题。计算生物信息学是交叉学科,又是一个新兴学科,我们需要了解的知识涵盖面很广,教材又都是全英文的,每走一步都需要投入大量精力。

  博士生从一开始就要读高水平的英文论文,对此,有的学生会有畏难情绪。我坚持认为,万事开头难,你的起点高了,那么你迈出新的一步就会比别人高得多。本来就站得低,就算脚能抬高些,又能走到多高的地方?

  所以说,还是要沉得下来认真地踏实地做事。

  受访人小传:

  高琳,计算机学院教授,博士生导师,学术带头人。2004至2005年赴加拿大圭尔夫大学作访问学者。主要研究方向:计算生物信息学,生物数据挖掘,图论与组合优化算法及应用。2011年4月在计算机学院成立了“计算生物信息学研究所”。

  《西电科大报》2012年8月25日第3版

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计算机学院高琳:讨论交流对研究工作促进很大
发布时间:2012-08-30 16:45:59来源:党委宣传部点击:我要评论: ()

讨论交流对研究工作促进很大
——访计算机学院高琳教授

  学生记者 闵青云 韦钰

  记 者:高琳老师您好,感谢您接受本报的采访。请简单介绍一下您在加拿大圭尔夫(Guelph)大学访学时的研究工作。

  高 琳:我读博士时的研究方向是生物计算,研究的计算问题需要生物实验验证,如果毕业后继续这个方向,我在西电的科研条件无法满足这种新兴的交叉学科的实验需要。于是我便想出国深造,希望能够进一步找到这个涉及数学、计算机、生物的交叉学科里我适合的方向。

  我申请了国家留学基金委的访问学者计划,得到公派出国深造的机会。随后联系了Guelph大学的DavidK.Y.Chiu教授,他在该领域进行了长期的研究。Guelph大学连续多年在加拿大国内大学排名位列前十,也曾被评为加拿大最全面的大学。为此,我感到十分荣幸。访学期间,Guelph大学优良的教学和科研氛围、强大的师资力量以及合作导师DavidK.Y.Chiu教授对我的帮助使我对生物信息学这门学科有了更深入的了解。在这里,我寻找着要研究的方向,努力结合自己熟悉的理论知识。访学期间,我完成了Chiu教授开设的生物信息学课程的学习,参与了他们的讨论,也完成了一个国家自然科学基金资助项目——《生物分子网络数据分析中相关图问题及其算法研究》的申请,得到资助。该项目的成功申请,对于我以后的研究起到了至关重要的作用,后来我在该领域的研究中得到国家自然科学基金的重点项目以及重大研究计划项目的资助。

  记 者:国外高校课堂上的交流氛围和国内相比如何?这对于您回国后的教学、科研有什么影响?

  高 琳:与我合作的DavidK.Y.Chiu教授非常重视学术讨论。在他开设的生物信息学课程中,我们大家自由交流。此外,每周二上午是导师与我单独讨论的固定时间,分析一周来学习的心得和遇到的问题。教授很看重这个讨论。这样有规律而直接的讨论交流对我的研究工作促进很大。

  为了尽快熟悉这一领域,我在网上联系到了加拿大Waterloo大学的李明教授,他也是计算生物信息领域执牛耳的人。Guelph大学在圭尔夫市,Waterloo大学在滑铁卢市,两个城市虽不远,但是坐巴士往返也需要很长时间。让我感动的是,李明教授在知道了我需要乘坐巴士前往之后,主动提出要开车接我去Water-loo大学参与他们的学术讨论,丝毫没有一个学术名人的架子,更像是老朋友。国外大学自由的学术交流方式、单纯质朴的学术氛围对我触动很大。

  总的来说,访学时与合作导师良好的合作、密切的讨论,还有活跃宽松的研究氛围都让我获益良多。

  我们作为导师就是要给予学生正确的方向引导,和学生平等交流,善于发现学生的优缺点,同时放大学生的优点,缩小他们的缺点。积极的肯定很大程度上是一种推进研究的动力。导师要了解学生的心理,做到及时疏导、减轻他们的压力,营造一个轻松的研究环境。

  记 者:访学期间,您积极与国外同行联系,建立了良好的关系和工作沟通渠道,搭建了合作平台。请问您与国外研究者沟通时最重视最注意的一点是什么?

  高 琳:我属于性格乐观的一类人,平时与人交往真诚相待,做研究是一件很快乐的事情,为什么要那么严肃呢?在加拿大时,我在Guelph大学里的研究常常会遇到各种生物方面的问题,恰巧DavidK.Y.Chiu教授有个学生在这方面很擅长,我就经常向他请教,他的解答也很热情、耐心。这件事以及李明教授接送我往返两所大学等事情说明,我身边有很多善良热心的人,他们学术有成,为人挚诚。这不仅很让我感动,也是我肯定的交往方式。

  大家在一起相识不就是因为彼此对学术上的热爱吗?简单、真诚是我一直追求的,也是我一直以来做人的方式。要把复杂的事物简单化、乐观向上,才能使自己有积极的态度。我认为人生就是要简单真实,不需把问题复杂化。生活本不容易,为什么不尽量过得开心一点、轻松一点呢?

  研究需要与国内外同行进行广泛的交流,近年来,我参与的学术活动比较频繁,主办或参加了IEEEISB会议(IEEE InternationalConference onSystem Biology)、IEEE BIBM 会 议(IEEE InternationalConference onBioinformaticsandBiomedicine)、全国生物信息学联合会议、基金委“生物信息学重大基础科学问题及关键技术”双清论坛学术研讨会等活动。这类顶尖的学术会议可以促进学界同行们的交流,又能给年轻人提供一个沟通的平台。这也算是我为自己喜爱的事业尽了一份力。

  记 者:访学经历对您的教学工作有哪些积极影响?您是否把一些国外经验结合到了自己的教学研究当中?

  高 琳:我从国外回来以后,也借鉴了他们的经验——每周举办一次课题组的讨论班。每学期末,我都会让学生写这一学期的总结以及对下一学期的计划,然后我会分别找同学一对一沟通讨论,平时学生每个月都要写总结。高年级研究生每个人每学期做一次面向我和其他同学的报告:讲论文,讲想法,这既能引起同学们的讨论和思考,也训练了他们的 “输出能力”——即总结归纳、深入浅出的能力。这对他们自身的素质提高有很大的帮助。

  西电的学生本身基础都很好,老师应该为学生的发展创造尽可能多的有利条件。我现在和国内许多优秀的研究机构如中科院数学与系统科学研究院、中科院计算所、上海生科院等有比较密切的联系,和许多学术名家、一线研究者也保持了较好的互动。我有许多优秀的学生都到了那里去学习深造。而且这些机构负责人、研究员也经常到我校做报告。频繁的学术交流给学生提供了很多机会,也让大家接触到了一流的前沿的信息。现在,我的学生们也经常通过邮件、电话等方式,与这些战斗在研究工作最前线的 “学术中坚力量”进行交流沟通。我做这些都是为了让学生能有更好的发展,让他们即使身处内地,也能放眼世界。

  博士生通过两年的深入学习与钻研,在主攻具体方向的知识应该超过自己的导师,之后我反而要向他们学习。学生是老师最重要的财富!

  记 者:您回国后在学院成立计算生物信息学研究所的初衷是什么?

  高 琳:科研需要不断找到新的学科增长点。计算生物信息学(Com-putationalBioinformatics)是生命科学中以数学、统计、计算机与生物医学为基础的新兴的交叉学科,且是以数学、统计为手段,以计算机为工具对生物数据进行储存、检索和分析的科学。随着人类基因组计划(HGP)的不断推进及生物技术的发展产生的新型数据,借助计算机的算法及软件对这些数据的分析成为该领域目前研究的焦点,计算生物信息学已经成为当今生命科学和自然科学的核心领域和最具活力的前沿领域之一。

  成立研究所的宗旨在于开展生物信息技术领域的原创性研究,建立具有广泛应用前景和国际先进水平的生物信息分析、数据挖掘和知识发现的理论体系。我希望依托西电信息学科优势,用信息和系统的观点和方法研究现代生物学和医学科学中的基础问题,促使西电在这一交叉领域快速发展,占领新的信息应用领域制高点,拓展西电新的学科方向,并在研究中培养前沿研究人才。

  记 者:高老师,最后请您结合您多年的治学经验,以一个过来人的身份给广大西电学子一些学习建议好吗?

  高 琳:个人的精力是有限的,一个阶段只能做一件事情,要做,就要尽力把事情踏实地做好。如果你想要别人认可你,你需要有一个“标签”,使得别人一看到你,就能知道你擅长某一领域。

  要想日后在科研上有建树,本科时期要打下坚实的基础。随着时间的推移和研究的深入,你对基础知识的理解就越是深刻。创新的源泉就是基础。研究生、博士生阶段主要是丰富自己对某一问题深刻的认识,并上升到理论的层面解决。对博士生的要求是撰写论文,加强自身学术研究能力,积累学术经验。只有自己的学术经验积累到一定程度,站在了一定的高度上,才能有更多的机会,才可能有更好的发展。

  我们的研究不但需要数学、计算机专业扎实的基础理论知识,也需要学习基本的分子生物学基础知识,以理解解决问题的背景。一本全英文生物教材,为了让学生更透彻地了解,我要求他们自主学习,分工讲解。长的章节两人讲一章,短的章节一人讲一章,每两周进行三次讨论。这种授课模式虽然很累,但是很能解决问题。计算生物信息学是交叉学科,又是一个新兴学科,我们需要了解的知识涵盖面很广,教材又都是全英文的,每走一步都需要投入大量精力。

  博士生从一开始就要读高水平的英文论文,对此,有的学生会有畏难情绪。我坚持认为,万事开头难,你的起点高了,那么你迈出新的一步就会比别人高得多。本来就站得低,就算脚能抬高些,又能走到多高的地方?

  所以说,还是要沉得下来认真地踏实地做事。

  受访人小传:

  高琳,计算机学院教授,博士生导师,学术带头人。2004至2005年赴加拿大圭尔夫大学作访问学者。主要研究方向:计算生物信息学,生物数据挖掘,图论与组合优化算法及应用。2011年4月在计算机学院成立了“计算生物信息学研究所”。

  《西电科大报》2012年8月25日第3版

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